中國科學(xué)院華南植物園海外知名學(xué)者John Seymour Heslop Harrison教授領(lǐng)導(dǎo)的研究團隊，在象腿蕉染色體級別基因組組裝研究方面取得新進展。相關(guān)研究發(fā)表于Gigascience。王梓維為該文第一作者，John Seymour Heslop Harrison和劉青副研究員為通訊作者，華南植物園教授葛學(xué)軍和法國農(nóng)業(yè)科學(xué)中心教授Mathieu Rouard參與該項工作。
象腿蕉是芭蕉科中耐寒的蕉類植物，原產(chǎn)于中國云南和東南亞地區(qū)，具有重要的觀賞、飼用和藥用價值。研究人員采用單分子納米孔、Illumina測序策略，結(jié)合染色體構(gòu)像捕獲技術(shù)，發(fā)表了首個象腿蕉染色體級別的基因組序列，長度為481.5 Mbp，完整性較高（BUSCO 98.3%），注釋獲得36,836個編碼基因，重復(fù)序列約占基因組的55%。
象腿蕉與芭蕉屬代表物種的比較基因組學(xué)研究發(fā)現(xiàn)，象腿蕉的長末端重復(fù)序列的組成及其插入時間，與芭蕉科其他物種均有差異，芭蕉屬比象腿蕉屬有更多Copia，象腿蕉LTR插入時間（峰值3.5–5 Mya）比芭蕉屬物種（峰值2 Mya）更古老，還發(fā)現(xiàn)芭蕉科在9和11染色體基數(shù)進化過程中復(fù)雜多樣的染色體重組事件。該研究結(jié)果為蕉類作物保育和改良提供重要的基因組資源。
該研究工作得到了華南植物園海外知名學(xué)者項目、國家自然科學(xué)基金、廣東省基礎(chǔ)與應(yīng)用基礎(chǔ)研究基金的資助。
相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1093/gigascience/giac027
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